VS2005 なんですが、生成したアプリケーションがランタイムエラーで起動しません。
VC6.0では問題なく動いたのですが・・・・。

なぜなんでしょう?
ＭＳＤＮ等ではマニフェストファイルを作成するようにとのことでしたが、
特に問題は無いと思っています