スミマセン,私の解釈がちょっと違ってたようで
プログラム内でjpgをppmに変える必要があるそうです

でもdjpegコマンドを用いるってプログラム内でlinuxのコマンド
用いて変換することって可能なのでしょうか

あともし>>76さんに書いて頂いたコードで出力データを別ファイルに
書き込んでデータファイル作る場合にはどうすれば良いでしょう
FILEのところに関数追加して書き込み用として開いて最後にfprintf?
ご教授お願いします