コンテナってのはSplitContainer 自体のことでいいのかな。
テスト的につくったフォームで試したところ、タブオーダーは
SplitContainer 0
TextBox1 0.0.0
TextBox2 0.1.0

となっていました。
貼り付けたコントロールは上記三つだけです。