GUI作成はC#のほうが圧倒的にやりやすいし、標準ライブラリもC++よりはるかに充実している。
悪い点は >>329 の通りだが、それ以外はいいこと尽くしだろ。
Vistaが普及して.NET標準装備になってさえくれれば、C#は選択肢としてかなり良くなる気がする。
まあ、Vistaが普及するかが問題なのだが。