俺はVS2005スタンダードだから、2008EEでも同じかはわからないけど、ツール - オプションの全ての設定を表示にチェック入れた?
チェック入れたら、環境の自動バックアップでソースコードの自動バックアップしないようにできるけど。
2008からは変わったのかな…。