>>483
topで確認したら予想以上にメモリを食っていました.
単体では,問題無いようですが,他のプログラムが走ったときに確かにメモリ不足になりそうな感じでした.
#使っているPCが共有マシンなので,他の方も違う計算をさせる可能性があります

一回のキャッシュを少なくして,マシンを占有させてもらって動かしてみたところ今のところ問題なく動いています.
データ収集のの3/4を無事終えたので残りもそのままいけそうです.
ありがとうございました.