＞VCで作成したプログラムを、Linuxで起動しても、起動しません。
＞作業としては、VCでコンパイルしたEXEファイルをLinuxに移動しただけなのですが。

それで動かないなら

VCで作成したプログラムを、Linux上のVC互換コンパイラで
再度コンパイルしてLinux用のEXEファイルを作るしかないでしょう