サーバをWindowsにしてしまって、純Windowsで開発してしまえば
コード変換や処理系の混在もなく、話は早いのですが、UNIXは
コマンドラインからの遠隔操作がしやすいので、UNIXを使用しています。
いちいちサーバ室に移動してモニタを確認して再起動や設定を行うのも面倒ですし。
VNCを使って強引に運用しても良いのですが、そもそもWindowsが
遠隔操作用のサーバとして作られていない（Serverを除いて）ので
色々な制限によって非常に使いづらい思いをさせられると思います。
個人なのでServerを買うほどのマニアでもないのでｗ