gitはどうかしらないけどhgはCVSとか.svnに相当する.hgディレクトリがルートにしか作られないのがすき。
それ + .hg自体がリポジトリなのでリポジトリの作成が気持ち的に軽い気がする。
なんかのファイルをいじるときにとりあえずhg initってのをよくやるようになった。