WEBプログラムの作業コピーを開発用サーバに置いて、
sambaで経由で編集して開発していますが、
例えばCGIが吐き出したディレクトリでオーナーがapacheの場合、
バージョン管理に追加しようとしても権限の関係で.svnを作れずにエラーになります。
WEB開発している人はどのようにして使ってますか?