普通に作ると一度実行するとファイルの中身がキャッシュされるので、メモリに収まるような少量のデータでテストすると１回目と２回目以降ではDISKアクセスに関してはまったく異なる挙動になります。
そこも考えてプログラムもテスト用データも作る必要がありますよ。