production logだけど、遅くなってる時はproduction.logの処理時間も遅くなってるんだよね?
apacheでは処理時間だしてる?

apacheで表示される処理時間と、同じリクエストのproduction.logを見てみな。

どっちみちWEBアプリでユーザーのCPUリソースが90%超えるとかありえないから
どっかおかしいんじゃないかな。それか 凄く思いロジックを凄いぼろい鯖でやってる?