返事がすごく遅れて申し訳ありません。アドバイスありがとうございます。

>データ量Nに対して処理のオーダーがNのX乗になっている部分を探し、
>よりオーダーの小さいアルゴリズムに変更する。
オーダーがNのX乗になる部分の探し方がわからないです。
まずはぐぐってみます。

そして、実行時間、実行回数が多い関数を探し出し(プロファイル使用。
使用したことはないのですが・・・)、その部分のより適した
計算方法を検討することを行ってみます。

大体このような流れでみなさんも処理時間の短縮を図っているのでしょうか？