いやjdk6に入ってるjs.jarはスループット優先でRhinoの機能かなりとっぱらってサイズ減らしてるんだよ。
さらにコンパイラ省かれてるから一切最適化されてない純粋なインタープリタで動いてる。

Rhinoのドキュメントに組み込みガイドがあって
そこにスループット優先でビルドする手順が書かれてるんだけどそれと同じ事してる。+JavaAdaptorが劣化。

jrunscriptはそのRhinoのScripting APIに従った純粋なラッパー。

Rhinoの殆どの実装クラスがjavax.script.*じゃなくてcom.sun.*にあるから自分でJSオブジェクト実装とかクラスシャッターでセキュリティ制限とかできない問題もある。
ecmaスレで詳しい話題が出てるよ。