変わってたらコンパイル済みの関数使えなくなるし
IPLの互換性がなくなると思って見たが
http://opencvlibrary.cvs.sourceforge.net/viewvc/opencvlibrary/opencv/cxcore/include/cxtypes.h?r1=1.35&r2=1.1
（365行目あたり）
変わってない。
コンパイラが違って構造体のアライメントが違ってるだけじゃないか。