Cygwin上でOpenCV1.0.0をインストールして随分と使っています。
前からアレ？と思ってはいたのですが、
highguiを使用しているプログラム(ウィンドウやcvWaitKey)では、
更にいくつかの条件を満たしていないとプログラムが強制終了してしまいます。
具体的に見つけたケースとしては、実行されなくても良いから
cvMinEnclosingCircleやcvCvtColorを書いておく必要があります。

インストールに失敗しているのか、
何か手順が足りないのか分かっていません。
このため、他から持ってきたプログラムを動かせないケースがあったりして
困っています。何か御存知の方、いらっしゃいますか？