つまり・・・
リポジトリにインポートする時点で各ファイルのタイムスタンプがバラバラで、
そのタイムスタンプを見て何かしら作業したいってことかな?

目安でいいんならタイムスタンプの時期ごとにわけてコミットすれば?
プロパティに設定するという手もあるけど、参照がしにくいかな。

正直、おれなら単にもとのアーカイブを参照するが。
わざわざリポジトリ経由で参照したい意味がわからんし。