早速のアドバイスありがとうございました。
Swing用のスレがあったんですね。。
スレ違いになってしまいますが、話の続きなのでここで書かせていただきます。


以下のようにリスナのadd先をGlassPaneにして、setVisible(true)を追記しました。

getGlassPane().addMouseMotionListener(new MyMouseMotionListener());
getGlassPane().setVisible(true);
.......

//内部クラス
class MyMouseMotionListener implements MouseMotionListener{
public void mouseMoved(MouseEvent e){
System.out.println(e.getX() + "," + e.getY());
}
.....
}

結果、マウス移動のイベントを拾ってはくれるのですが、
配置したコンポーネント（ボタン等）を全く押せなくなりました。
まさにアプリの上にガラスを被せたような状態ですｗ

マウス移動のイベントだけガラスに拾ってもらいつつ、
マウス押下のイベントはガラスを突き抜けて、下のコンポーネントに到達させる様な挙動はさすがに無理なのでしょうか。
ちょっと都合が良すぎる考えのような気がしてきました。。