プログラムを起動する、という言葉は、どういう意味で使ってますか？

任意のプログラムをWindows上で起動させることなどはどんな言語にも不可能ですが
Windowsの実行ファイルをJavaプログラムから起動する事は可能です
多分これが質問の意味だと思いますが