ありがとうございました。
XML エディタ で検索してみましたが、どうもよく分かりませんでした。
ちなみに見出しは全部でaからzまで数十万あります。
ダブり語は多分、数千種類が各2〜7個くらいダブっています。
差し支えなければ、使えそうな専用エディタを教えて頂けないでしょうか?

ファイルのパースさえ出来れば楽勝だろうとおっしゃるのは素晴らしいです。
ちなみに楽勝というのはperl で、ですか? 
機械で読むというのがよく分からないのですが(すみません)、多分txt形式で
50MBくらいのファイルになりそうで、そこまでは出来ます。