自己レス

FTP resume perlをキーにググッたら下記の情報見つけた
http://www.garayed.com/perl/215162-net-ftp-resume-file-transfer.html

perldoc Net::FTPでWHEREを見ろって書いてあったので見たら
ダウンロードはgetメソッドの第3引数でオフセット値が指定できるみたいだけど
アップロードはrestartってメソッドでオフセット値をセットしてから
putメソッドで転送すればいいのかな。

しかしputメソッドは第3引数でオフセット値を指定できないんだ？？？