ドトネトならお望みの動作一撃なんだがな・・・・

１．プログラムが起動したらAPIで現在アクティブなウィンドウハンドルを取得

２．で、そのアクティブなウィンドウハンドルを保持して
そのフォームの中の処理でWindowsで現在アクティブなウィンドウを常にチェック

３．比較して起動時と異なっていたらアンロード

２はフック使ったほうがスマートかもしれんが
なんとなくこんなの思いついてみたというのをかいてみた