こんばんわ。初めて質問させていただきます。

今、ＪＡＲファイルを作成しようと思い、色々とやっているのですが
インナクラスの扱い方がちょっとよく分かりません。
マニフェストファイルを作成し、普通のクラスをいくつかまとめてＪＡＲファイルにすることはできたのでるのです。
しかしそこにインナクラスがひとつでも絡むと
そのクラスについてのみ「●●.classというファイルまたはディレクトリはありません」
というメッセージがＤＯＳ窓に表示されてしまうのです。
で、その●●というインナクラスを持つ、△△クラスだけでＪＡＲファイルにしてみたのですが
そうすると今度はＪＡＲファイルにはなるのですが、それをダブルクリックしてもエラーメッセージが出るだけになってしまって・・・。

素人丸出しの質問で申し訳ないのですが、どうかよきアドバイスをよろしくお願い致します。