いまさらな書き込みだがUSBインターフェースつきの基板の場合
内部ではCPU等が標準で持っているシリアルインターフェースに
USB-シリアル変換器を組み合わせているというタイプも多い。

この場合パソコンとの接続は仮想COMポート経由ということになるため
この部分で自動的に区別がつくことになる(１台目はCOM3、２台目はCOM4のように)

ただしコールドスタート時から接続しておく場合は
どちらがどちらに割り当てられるかケースバイケースということになりかねないため
接続を確認する処理の中で個々の識別ができるような仕掛けが必要となる。