ちょっと前に、スプラッシュウィンドウの実装についてあちこちで議論があったのを見たんだが、
こんなやり方では駄目なんだろうか？

public static class Program
{
[STAThread]
private static void Main()
{
Application.EnableVisualStyles();
Application.SetCompatibleTextRenderingDefault(false);
Application.Idle += Application_Run;
Application.Run();
}

private static bool _applicationRunning = false;
private static void Application_Run(object sender, EventArgs e)
{
if (_applicationRunning) { return; } else { _applicationRunning = true; }
Application.Idle -= Application_Run;

//ここにスプラッシュウィンドウだの、メイン処理だのを書く
//プログラムを終了させるべき場所にApplication.Exit()を書く
}
}