ILMerge を使って試しに1本のファイルを作ってみたところ、確かにそれ1本だけで動作しました。

>>780
どうも’MSIL へのコンパイル ’
http://msdn2.microsoft.com/ja-jp/library/c5tkafs1(VS.80).aspx
によりますと、

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”MSIL とメタデータは、実行可能ファイルのファイル形式として使用されてきた従来の Microsoft PE と
COFF (Common Object File Format) に基づき、それらを拡張したポータブル実行可能 (PE) ファイル
に格納されます。

MSIL、ネイティブ コード、およびメタデータを保存できるこのファイル形式を使用すると、オペレーティング
    ~~~~~~~~~~~~~~~~~~
システムが共通言語ランタイムのイメージを認識できるようになります。MSIL と共にメタデータが
このファイルに格納されるため、コードは自己記述型になります”
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とあり、どうも VS開発環境 および ilasm が出力する exe ファイルそのものが、
 「ポータブル実行可能 (PE) ファイル」
であり、ということはその中にすでに ネイティブ コード が埋め込まれているかのような説明に読め
ましたが、現実にPE形式のファイルにはすでに JITコンパイルされた後にできるはずの ネイティブ コード 
が含まれてしまっているのでしょうか?