ハードウエアFIFOは16バイト固定で、これが溢れるまでに割り込みがかかればOK
リングバッファは設定可能で、その設定したリングバッファが溢れるまでにアプリ層からアクセスすればOK

という事で、正しく調整されれば、まず溢れる事はないだろう。
もっとも割り込みが1mS禁止されるなどの状況がありえるパソコンなら別だろうけど