SCMなんて単純にテキストエディタのUNDO管理/変更履歴機能程度に
考えておいた方が色々気が楽だと思うけどなぁ。
ウチの場合は、開発中は自由にSubversion/CVSにコミットしていって、
(もちろんコンパイル/デプロイできるのが当然条件だけど)、
本番リリース前のwar+ソース一式だけtarやzipで固めて、
共有ディレクトリに置いて管理してる。

698は要約するとめんどくさいから要らない、って言ってるだけに見えるけど、
Javaとかのオープン系で上記の管理してるんかね?