レスありがとうございます。
お蔭様でなんとかビルドエラーは解消されましたが、実行でエラーが出たのでサンプルを元に1つ1つ解消していくことにしました。
しかしまたエラーが出てしまい、調べても解決出来ませんでしたので手を貸していただけないでしょうか。

2006Augのサンプル[C++\Direct3D\SkinnedMesh]をフォルダごと[d:\test\]以下にコピーし、変更を行った結果

>error C2859: d:\test\skinnedmesh\debug\vc70.pdb は、このプリコンパイル済みヘッダーが作成されたときに使用された pdb ファイルではありません。プリコンパイル済みヘッダーを再作成してください。　(ファイル)SkinnedMesh
のエラーが出ます。
エラー元はCommonフォルダ内の各ファイルに記述されている「#include "dxstdafx.h"」のようです。
変更は
・ソリューションエクスプローラー　[Common]フォルダのファイルとアイコンの相対パスを下記に修正
　　C:\Program Files\Microsoft DirectX SDK (August 2006)\Samples\C++\Common\(ファイル名)
・プロジェクトの追加ディレクトリを上記に
です。
リビルドやDebugフォルダを削除したりしているので前のビルド結果が残っていることはありません。
サンプル「SkinnedMesh」を同じ階層に「SkinnedMesh2」としてコピーし、
ファイルの相対パスに別の場所に置いたファイルにするとこの時点で上記のエラーが出ます。
他に変更する点があるのでしょうか。
尚、現在文字セットはサンプルと同じくUnicodeです。