バイナリが一致しているかどうかを高速で調べるような方法ってないでしょうか。
検索しておけるなら、あらかじめハッシュを生成しておけばよいと思うのですが、
ファイル数が多くて、大きなファイルになると、ハッシュ生成時間もばかになりませんよね。

この辺の分野ってなんていうんだろうか。