>>480
ファイルバージョンは、EXE のプロパティに表示される値。
.NET の世界では重要な意味はないと思う。

アセンブリバージョンは、アセンブリの厳密名を構成する要素のひとつ。
アセンブリのバージョン管理に関わる。
（「厳密な名前」で署名する場合。）

ちょっと難しいけど、↓これが参考になると思う。

＠IT：インサイド .NET Framework ［改訂版］
ttp://www.atmarkit.co.jp/fdotnet/technology/idnfw11_index/