しかし、
簡単な方法が>>742で見つかったな。

http.conf(またはsubversion.conf)の
SVNリポジトリを設定している<Location>タグで
DAV svnと書いてあるところに
SecFilterInheritance Off
を追加するだけでいいっぽいな。
これならmod_securityもつかえてかつSubversionでWebDAV
を使うこともできる。