音程が変っているのなら、サンプリング速度が変化しているからどこかの段階でLPFを入れておく必要があるよ。
そうじゃないと折り返し雑音が問題になる。
綺麗な音にしたいなら、最低２倍のオーバーサンプリングしておいた方がいいかもね。

音程が変らずに再生速度だけ変化させてるならサンプリング定理の問題じゃない
0.5を下回る場合に問題が出るという事は
0.5を下回ると同じ音を３度以上繰り返し利用しなければならなくなるけど
その処理がはいってないんじゃないの