>>107でレスがなかったのでもう一度、、、
クライアントのJREバージョンを見分けて、
それ毎に別々に読み込むＸＭＬライブラリを変えることは可能でしょうか。
たとえば、↓みたいに書くとか、、

String javaVersion = System.getProperty("java.vm.version");
if(javaVersion.startsWith("1.0") || javaVersion.startsWith("1.1")
|| javaVersion.startsWith("1.2") || javaVersion.startsWith("1.3")){
//apacheの外付けjarの処理を記入
}else if(javaVersion.startsWith("1.4")){
//crimsonを使用した処理を記入
}else{
//組み込みxercesなどを使用した処理を記入
}