失礼。上に「com.nttdocomo.eclipseワーキングセットを作成」とか書いてるから、
ちゃんと所定の場所にフォルダはあるんだろうなぁ・・・

バージョンの違いでちゃんとインストールされてないのではなかろうか・・・
Dojaのバージョンは4.0以降ですか?