retroguardの最新版v2.2.0を落として動かしてみたんですが、
v2.0.5と同じようによびだすと、出力されるファイル(out.jar)として
MANIFEST.MFが入っているだけのほとんど空っぽのファイルが出力されます。
似たようなトラブルに遭った方、いますか?