sakura.exeのAMD64版の命令コードの逆アセンブルしてみますた。
VC2005 Expressにも付属するdumpbinツールを用いました。
http://download.kousaku.in/misc/sakura.asm.gz

かなり巨大なので注意。
x64アプリ全般における問題として、REXプリフィックスが付いたことで
16byte/clockのフェッチ帯域で律速され、4issueのパイプラインが生かすのは
困難であることが理解いただけるかと。
目視で、1命令平均5バイト程度で収まってます。

Athlon64のほうが速くなる云々は抜きにして、Core2で32bit版以上の
パフォーマンスを得るのは正直難しい気がします。