すみません、color値は頂点のです。
アルファ値を含むテクスチャの合成をしているのですが、ライトを切ってもテクスチャの色がそのまま反映されます。
合成方法を変えると透明な部分が黒で合成されるなど期待通りに合成されません。
頂点色は正常に設定されているためテクスチャ無しや合成無しでは反映されます。