具ぐってみて、MFCやATLがなくても、Win32Apiを使えば、
Windowsアプリケーションが作れることを理解しました。
ありがとうございます。

まだちょっと分からないのが、Expressを入れたときから
ネイティブ（Win32）のコンソールアプリケーションはつくれますよね。

CLRコンソールアプリケーションだと
using namespace System;
となってますが、Win32コンソールアプリケーションだと、
#include <stdio.h>
#include <tchar.h>
となっています。これは何を使おうとしているんでしょうか。
「Windows Platform SDK」でも「.NET」でもないと思うんですが。。