>>796
関数内で宣言した変数のために使えるメモリは意外と小さい。（通常1MiBytes程度）
動的確保するのが理想だが，とりあえずは796の配列変数を全て静的変数にしてみろ。
char ac[5000][5000];→static char ac[5000][5000];