とりあえず簡単なサンプル。名前に「WinFS」が入ってるファイルを検索。

using System;
using System.Storage;

class WinFSTest {

  static void Main() {
    using (WinFSData fs = new WinFSData()) {
      foreach (Item item in fs.Items.FilterByType<GenericFile>().Filter("NamespaceName like '%WinFS%'")) {
        Console.WriteLine("{0}: {1}", item.ShellPath, item.GetType());
      }
    }
  }
}

実行結果はこんな感じ。
\winfs_website.gif: System.Storage.GenericFile