解決手段の見当がつかず困っています。。

USBのキャプチャユニットとそれに接続するCCDカメラがあります。
USBキャプチャにはドライバとキャプチャソフトが付属しており、
それを使うとGUIから任意のタイミングで画像を取り込むことがで
きます。

今回はCCDカメラに映った映像をコマンドラインから操作して画像
を取り込む必要があります。

※イメージとしてはCygwinなどでコマンドを打てばそのタイミングで
  画像をフォルダに保存するといったようなことをしたい。

要はGUIソフトの機能をCUIで実現したいのですが、どのような方法
で取り組めばよいのでしょうか。

環境はWin2000で実現するのに使う言語はなんでもいいです。