思いっきりレベル低い内容だが報告。
オプションＡＰＩのMathのatan2。
D900i滅茶苦茶遅い・・・。

テスト内容は適当な引数を入れたatan2を２５６回
連続して計算させて経過時間を計測した。
D900i：2370〜2380ミリ秒
N901i：1〜2ミリ秒

差がありすぎるので自作して回避。
何かつくるとDで実験するのが日課になったなぁ・・。
以下その際のソース
o = System.currentTimeMillis();
for(i = 0;i < 256;i++)
j = com.nttdocomo.opt.ui.j3d.Math.atan2(-555,340);
n = System.currentTimeMillis();
System.out.println(n-o);