>ttp://www.forest.impress.co.jp/lib/sys/hrdbnch/hardinfo/mobilemeter.html
>マウス操作を透過させることも可能。
>これにより常にデスクトップに表示していても、
>本ソフトの下に表示されているほかのソフトを自由に操作することができる。
例えばこういうソフトでやられているようなことをしたいわけです。

「WM_NCHITTESTでHTTRANSPARENTを返す」という方法を見つけたんですが
これでも操作を受け付けなくなるだけでした。