>>477でAOPの一括設定方法について質問した者です。
頂いたアドバイスに従って自作で作ってみました。registAll()が初期化メソッドになります。
全ての登録コンポーネントの取得方法や、ComponentDefの初期化方法がよくわからないまま作ってしまいましたが・・・

private Class classObj;
private AspectDef aspectDef;
private S2Container container;

public void registAll() {
  S2Container root = container.getRoot();
  registContainer(root);
  for (int i = 0; i < root.getChildSize(); i++) {
    S2Container ct = root.getChild(i);
    registContainer(ct);
  }
}
private void registContainer(S2Container ct) {
  for (int i = 0; i < ct.getComponentDefSize(); i++) {
    ComponentDef cd = ct.getComponentDef(i);
    regist(cd);
  }
}
private void regist(ComponentDef componentDef) {
  Class componentClass = componentDef.getComponentClass();
  if (classObj.isAssignableFrom(componentClass)) {
    componentDef.addAspectDef(aspectDef);
    componentDef.destroy();
    componentDef.init();
  }
}