perl -pi.orig -e 'BEGIN {undef $/;} s/\n+$/\n/s' *

-iオプションは便利だ。

ただしメモリに読み込めないくらい巨大なファイルだとこのやり方では
まずい。それほどでかいとお尻から読んでtruncateしたいとこだがかなり
めんどくさくなるだろうなぁ。