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情報が小出しになってしまっていてすいません。

確認はtomcat上のJSPを利用して確認しています。
rpmとbinでの切り替えはCLASSPATHの設定を変更する
ことによって行っています。
その際、tomcatの再起動も行っていますので、残るといったことは
ないはずです。