ちょとと可能かどうか伺いたいんですが、
BCELとかJava5の機能(クラスファイルのバイトコードを扱える機能が加わりましたよね)で
コンパイル済みのクラスファイルの中をいじくって、Threadクラスを独自実装のThreadクラスに置き換える
とかいうこと(Threadを継承したクラスとかに)はできますでしょうか?
javaのTreadクラスそのものを独自の実装に変えたいというわけではありません。Threadクラスが使われている
場所を任意実装のクラスに置き換えたいというだけです。
 おねがいします。