＞あんまり Apple はカスタムコントロールをつくるのは推奨してない気がするし、

これが今の時代の開発ではネック。

＞そういうことすると OS X ぽくないソフトになりがちで嫌われがちだと思われる

だからコントロールを派生して元々OS Xの描画の上に描画を足したり処理を足したりするわけじゃん。