Webアプリ開発をメインに学習してるJava初心者です。
Webアプリでは様々なツールを連携させて開発するので
一応下記の物を入手しましたが

J2SE 5.0
J2EE 1.4
Eclipse 3.0.1
Tomcat 5.5.4
mysql 4.1.7
Apache 2.0.52
JBoss 4.0.1
Struts 1.2.4
jakarta-taglibs
Ant 1.6.2
JUnit 3.8.1
Cactus 1.6.1

これらを連携させるとの概念で少し詰まっています。
それぞれのツールのインストーラーを起動させてプラグインするのは
分かるのですが、それをどれに対してするのかが曖昧です。
標準的な組み合わせ法を教えてください。